Na treći stepenik pobedničkog postolja popeo se Valentino Rosi, posle velike borbe sa timskim kolegom Horheom Lorencom, koji će izvesno već naredne nedelje u Maleziji obezbediti prvu titulu u kraljevskoj klasi.
Pošto je trka u Japanu protekla bez vozača "Repsol honde" Danija Pedrose, koji se povredio tokom slobodnog treninga u petak, Lorenco je došao na samo korak od titule šampiona. Pedrosa je u subotu operisan u Španiji i najverovatnije će se na stazu vratiti tek za dve nedelje u Australiji, što znači da je vozaču "Jamahe" (Yamaha) potrebno samo šest bodova na stazi "Sepang" da bi obezbedio titulu, koja je izvesno već sad
njegova.Od starta na "Motegiju" poveo je Doviciozo, ali je Italijan vrlo brzo izgubio vođstvo kada ga je pretekao Stoner, a iza tog dvojca sledili su Lorenco, Rosi, vozač "Jamahe teh 3" Kolin Edvards, Loris Kapirosi na "Suzukiju", vozač "San karlo honde gresini" Marko Simončeli i Ben Spiz na "Jamahi". Posle mirnog prvog kruga, u drugom su sa staze izleteli Spiz i drugi vozač "Dukatija" Niki Hejden, koji su se vratili na stazu na samo začelje, na 15. i 16. mesto.
Stoner je od početka krenuo da niže najbrže krugove na trci, dok se Rosi vrlo brzo primakao Lorencu, koji se malo i kockao pošto je izabrao prednji mek pneumatik. Uprkos tome što je bio vrlo blizu svog timskog kolege "Doktor" nikako nije uspevao da nađe put pored Španca, dok se u isto vreme Marko Simončeli na privatnoj "Hondi" ekipe "San karlo gresini" probio do petog mesta.
U petom krugu Rosi je napokon uspeo da se nađe ispred Lorenca i dođe do treće pozicije, a iako je "Doktor" odmah krenuo da niže brze krugove nije uspevao da se približi vodećem dvojcu. U međuvremenu, posle izleta sa staze Spiz se probio do
desete pozicije, dok je njegov timski kolega Kolin Edvards pretekao Simončelija u borbi za treće mesto.Posle nekoliko krugova tokom kojih Rosi i Lorenco nisu uspeli da uhvati priključak sa Stonerom i Doviciozo, sedam krugova pre kraja Španac se našao ispred svog timskog kolege, ali samo na kratko, pošto je "Doktor" ubrzo uspeo da mu uzvrati. Do kraja trke borba između vozača "Jamahe" je bila najzanimljivija, ali nije pružila jedino uzbuđenje na "Motegiju".
Četiri kruga pre kraja Spiz je pretekao drugog vozača "San karlo gresini honde" Marko Melandrija, a Italijan je dva kruga kasnije imao izlet sa staze. U isto vreme, vozač "Suzukija" Alvaro Bautista se probio do sedmog mesta, zahvaljujući nesreći timskog kolege, pošto se Kapirosiju isključio motor.
U pretposlednjem krugu borba između Rosija i Lorenca se intenzivirala, i njih dvojica su čak imala dva kontakta, dok su u poslednjem krugu nekoliko puta razmenili pozicije. Na kraju je "Doktor" bio taj koji je izašao kao pobednik iz tog duela, već kada je Stoner
proslavljao svoj drugi uzastopni trijumf, ispred Dovicioza. Iza prve četvorice sledili su Edvards, Simončeli, Bautista i Spiz, dok su prvu desetoricu na 14. trci sezone kompletirali Randi de Punije na LCR Hondi i vozač Interveten Honde Hiroši Aojama. Pored njih, do bodova su na "Motegiju" došli i Melandri, Hejden, Hektor Barbera na Aspar Dukatiju i dvojac Pramak Dukatija Aleks Espargaro i Mika Kalio.
Rezultati trke za Veliku nagradu Japana:
1. Kejsi Stoner (Australija) Marlboro Dukati 43:12.266
2. Andrea Doviciozo (Italija) Repsol Honda + 3.868
3. Valentino Rosi (Italija) Fiat Jamaha + 5.707
4. Horhe Lorenco (Španija) Fiat Jamaha + 6.221
5. Kolin Edvards (SAD) Monster Jamaha Teh 3 + 27.092
6. Marko Simončeli (Italija) San Karlo Honda Gresini + 30.021
7. Alvaro Bautista (Španija) Rizla Suzuki + 31.826
8. Ben Spiz (SAD) Monster Jamaha Teh 3 + 35.572
9. Randi de Punije (Francuska) LCR Honda + 47.564
10. Hiroši Aojama (Japan) Interventen Honda + 49.598
11. Marko Melandri (Italija) San Karlo Honda Gresini + 49.999
12. Niki Hejden (SAD) Marlboro Dukati + 50.703
13. Hektor Barbera (Španija) Aspar Dukati + 51.422
14. Aleks Espargaro (Španija) Pramak Dukati + 52.843
15. Mika Kalio (Finska) Pramak Dukati + 1:14.668
odustao:
Loris Kapirosi (Italija) Rizla Suzuki
Generalni plasman vozača:
1. Horhe Lorenco 297
2. Dani Pedrosa 228
3. Kejsi Stoner 180
4. Andrea Doviciozo 159
5. Valentino Rosi 156
6. Ben Spiz 139
Generalni plasman timova:
1. Fiat Jamaha 454
2. Repsol Honda 387
3. Marlboro Dukati 309
4. Monster Jamaha Teh 3 309
5. San Karlo Honda Gresini 163
6. Rizla Suzuki 99
Generalni plasman konstuktora:
1. Jamaha 309
2. Honda 285
3. Dukati 220
4. Suzuki






















